Moder Natures perfekte design fører Da Vinci til det perfekte våben mod Rom. Firenze vil overleve for at kæmpe en anden dag, men Da Vinci må ikke.
Endnu engang er Da Vincis geni for meget for selv ham at håndtere (derfor dæmonerne).
Paven er indstillet på at tage Medicis ud og bygge sig en katedral. Riario samler sine mænd og begynder at skabe ravage og sender beskeder om blodsudgydelse tilbage til Lorenzo gennem en dreng, som Riario anså for trofast nok til at leve.
Riario vil ikke bare have byen. Han vil også have Da Vinci (Tom Riley) at arbejde for Rom.
Lorenzo er ved at miste sej og bringe sin vrede ned på sine egne folk og bruger alt fra offentlige tæsk til døden som en taktik for at holde folk loyale. Hans bror, Giuliano, advarer om, at der er forskel på styrke og grusomhed, men Lorenzo vil ikke høre det.
Giuliano opsøger Bechhi til råds og bliver overbevist om sin uskyld. Han beder Lucrezia om at appellere til Lorenzo på vegne af Bechhi og planlægger at finde den rigtige forræder.
Starz fornyer Da Vinci's dæmoner for en anden sæson >>
Wit er en bedre taktik end krig
Da Vinci bliver indkaldt til paladset. Lorenzo tager angrebet mod Firenze som en krigshandling. Lorenzo vil have våben fra Da Vinci. Selvom Da Vinci opfordrer ham til at bruge vid som en bedre taktik, fortæller Lorenzo ham at fortsætte med at bygge musketer.
Da Vinci mener, at der må være en anden måde at besejre Rom på. Han ved, at hvis musketterne bruges, vil paven kun blive besejret i et kort stykke tid. Snart vender Rom tilbage med sine egne musketter.
Da Vinci tager sagen i hænderne og ødelægger musketterne.
Fra granatæble til granat
Da Vinci bliver fuld og begynder at få syner af sine venner døende.
Lucrezia dukker op og trøster ham. De to tilslutter sig.
Lorenzo konfronterer Da Vinci. Han er rasende over, at Da Vinci ødelagde våbnene. Han forstår ikke, hvorfor Da Vinci gjorde det og ser det kun som en forræderi. Lorenzo forklarer, at han nu vil blive tvunget til at overgive sig som gidsel og bare bede Rom forlade byen alene. Da Vinci vil ride ud med Lorenzo for at møde Riario. Lorenzo fortæller ham, at hvis Riario vil have Da Vinci, kan han få ham.
I sin vrede kaster Lorenzo et granatæble. Måden det eksploderer ved siden af Da Vinci giver ham en idé.
Da Vinci rider ud med Lorenzo den næste dag, og lige før Lorenzo overgiver sig til Rom, stopper Da Vinci ham. Han smider Riario en lille syet bold (som ligner en baseball). Da Vinci forklarer, at det er et våben. Hvis den rammer jorden, eksploderer den, sender granater overalt og dræber snesevis af Riarios mænd.
Da Vinci afslører en vogn fuld af de små våben.
Riario indser, at Da Vinci har vundet denne runde. Inden han trækker sig tilbage, advarer han dog om, at der føres krig på mange fronter.
Lucrezia holder en stor hemmelighed
En hætteklædt figur bryder ind i fængslet, hvor Bechhi bliver holdt. Personen dræber vagten på vagt og taber derefter hætten. Det er Lucrezia. Hun er forræderen.
Hun fortæller Bechhi, at Rom har ejet hende i et par år, før hun og Lorenzo overhovedet var involveret. Derefter stikker hun Bechhi med en forgiftet dolk. Da han dør, advarer han om, at uanset hvad Rom har lovet, vil bystaten ikke ære det. Hun fortæller ham, at han ikke forstår. Magterne i Rom har mere imod hende end bare løfter. Hun ser handlingen med at stikke Bechhi som barmhjertighed. Hun vil ikke se ham slået ihjel på et hjul som de andre mennesker Lorenzo har lavet eksempler på.
Da Vincis ekspedition fører til fængsel
Da Vinci beslutter, at han vil starte en ekspedition til den nye verden. Han deltager i en fest for at ære hans geniale opfindelse, der forhindrede erobring af Rom. Men fejringen afkortes, når kaptajn Dragonetti ankommer og anklager Da Vinci for sodomi. Da Vinci er anholdt.
Der ser ud til at være to fraktioner med hensyn til Da Vinci. Enten er folk så rædselsslagne over hans geni, at de vil have ham død, eller også vil de misbruge hans evner for personlig vinding. Ingen er i tankerne om bare at lade ham være.